故事发生在天保14年的江户。当时在老中·水野忠邦实施的财政紧缩政策之下的老百姓生活在极度困扃中。国内政府的压迫，加上外国殖民者入侵的威胁，在江户的大街小巷中弥漫着一种不安的气氛。在不为世人所知的地下，存在着一个秘密的神社。这个神社表面上对外称是对外国传入的学术文化进行研究调查的「蛮社改所」，而实际上则是专门对付各国潜入日本的「妖夷」，并负责将他们秘密抹杀的政府隐蔽机关。该组织的头目名为小笠原放三郎，是个醉心于“兰学”，并极力证明其实用性的学者。然而却不得不听从南町奉行·鸟居耀藏的差遣。小笠原虽然没有了得的身手，但却与有着能将汉字中蕴藏的不可思议力量“汉神”诱导而出并具现化的高超能力的“妖奇士”龙导往压等人承担着暗中保护江户的职责。　　故事展开的天保年间正是德川幕府“锁国”　政策与外国势利用武力敲开日本国门德企图两者矛盾正深的时候。日本国内庶民食不果腹，底层武士阶级进一步没落，社会动荡，民不聊生。但同时通过各种渠道传入的西方文化，又对上至将军家老，下至平面百姓的日本社会产生了极大的冲击。本片中所提及的「妖夷」并非传统意义上的“化物”和“妖魔”，而很多是根据日本民众对西方文化一知半解，然后与民俗传说融合衍生出的产物。